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Mysql Workbench es la herramienta de modelado de base de datos para Mysql, entre sus características permite la ingeniería en reversa y syncronización con multiples bases de datos, además de forma automatica te genera los scripts.

Es multiplataforma, lo podemos descargar desde aquí, descargamos el paquete deb y lo instalamos.

En ubuntu 9.10, aparece el siguiente error :

Couldn't load library libmysqlclient_r.so

Bastará con crear el siguiente enlace simbolico:

sudo ln -s libmysqlclient.so.16 libmysqlclient_r.so

Y listo a modelar bases de datos.

Saludos